Керчь была одним из первых городов, попавших под удар немецко‑фашистских войск в начале войны. За годы войны через город несколько раз проходила линия фронта и он дважды был оккупирован вражескими войсками.
Во время оккупации в Керчи погибли 15 тысяч мирных жителей, а более 14 тысяч горожан были угнаны на принудительные работы в Германию.
Легендарной страницей истории Великой Отечественной войны стала упорная борьба и длительная оборона в Аджимушкайских каменоломнях. Активную борьбу с оккупантами вели подпольщики и партизаны.
За 320 дней, пока город был в руках врага, оккупанты разрушили все заводы и фабрики, сожгли все мосты и суда, вырубили и сожгли парки и сады, уничтожили электростанцию и телеграф, повредили железнодорожные линии на полуострове. Керчь была почти полностью стёрта с лица земли.
Самую крупную десантную операцию во время обороны Керчи в 1942 году осуществил Керченско‑Феодосийский десант. Благодаря ему оказались сорваны немецкие планы наступления на Кавказ, к нефтяным месторождениям. С наступлением 1943 года немецкое командование считало Крым одним из важнейших плацдармов, поэтому к Керчи были стянуты огромные силы: танки, артиллерия, авиация. Кроме того, немцы установили мины в Керченском проливе, чтобы не допустить прорыва советских войск в оккупированный Крым. Но Красная Армия смогла осуществить успешное наступление.В ночь на 1 ноября 1943 года началась Керченско‑Эльтигенская десантная операция, в результате которой советским войскам удалось захватить и удержать плацдарм севернее Керчи.
С этого подвига началось освобождение Керченского пролива и всего Крымского полуострова от врага.
Эльтиген, Аджимушкай, Багерово — эти места политы кровью защитников‑героев Керченского полуострова. Мужество воинов Отдельной Приморской армии отмечено самыми высокими наградами. За защиту и освобождение Керчи звание Героя Советского Союза получили 153 человека.
Город был освобождён 11 апреля 1944 года, а 14 сентября 1973 года Керчи присвоено звание Города‑героя.